در راستای اجرای مصوبه شورای پژوهشی مرکز و شناخت اولویت های این حوزه ها، پایگاههای پژوهشی مرکز در حوزه های معاونت درمان، بهداشت، و فرهنگی دانشجوئی استقرار یافتند. پایگاههای پژوهشی مستقر در حوزه معاونت بهداشتی از روز شنبه 25 آذر و در حوزه معاونت درمان از دی ماه سال جاری شروع به کار می نمایند.وظیفه اصلی این پایگاهها، شناخت اولویت های این حوزه ها و یافتن راههای مقابله با انها با تکیه بر عوامل اجتماعی موثر بر سلامت می باشد.